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분석 도구 한눈에 보기

각 도구가 무엇을 하는지만 간단히 정리했습니다. 도구 이름이나 설명을 누르면 해당 서비스로 이동합니다.

Preparation

ZINC22 CartBlanche	ZINC22에서 조건에 맞는 후보 화합물 라이브러리를 내려받습니다.
RDKit	분자 서술자와 지문을 계산해 화합물 세트를 정리합니다.
Ligand Prep	도킹 전에 소분자 구조를 보정하고 3D 형태를 만듭니다.
Protein Prep	수용체 PDB를 정리해 도킹과 MD 입력으로 준비합니다.
Sequence Crawler	NCBI와 UniProt에서 DNA/단백질 서열을 수집합니다.

AI Screening

ADMET Screening	후보 화합물의 약물성, 독성, ADMET 리스크를 빠르게 걸러냅니다.
GNINA Screening	로컬 RTX 5070 또는 Colab T4로 가상 스크리닝을 실행합니다.
DiffDock-L	결합 포켓 지정 없이 확산 모델로 도킹 포즈를 찾습니다.
DynamicBind v2	단백질 유연성을 고려한 결합 포즈와 애니메이션을 생성합니다.
AF2Bind	AlphaFold2 기반으로 리간드 결합 잔기 가능성을 예측합니다.

Refinement & Dynamics

GNINA Optimization	도킹 포즈를 재평가하고 MD 전 Pose QC를 수행합니다.
Molecular Dynamics	OpenMM 기반 MD로 결합 안정성과 상호작용 변화를 분석합니다.
MM-GBSA	단백질-리간드 복합체의 결합 자유 에너지를 평가합니다.

Rosetta Commons

RFdiffusion	표적 구조에 맞는 단백질 binder와 scaffold를 생성합니다.
ProteinMPNN	주어진 backbone에 맞는 안정적인 아미노산 서열을 설계합니다.
BoltzGen	타깃 잔기에 결합하는 peptide/protein/nanobody binder 설정을 만듭니다.

Auto GraphPad

Auto GraphPad	CSV나 Excel 데이터를 논문용 그래프와 통계 요약으로 바꿉니다.

Genomics & Evolution

ESM Phylo	단백질 서열 간 진화 거리와 계통수를 계산합니다.