RDKit Curation

Library Normalization & Standardization

Google Colab WorkerT4 GPU 무료

버튼을 클릭하면 RDKit Curation 노트북이 브라우저에 열립니다.
데이터를 업로드하고 셀을 순서대로 실행하면 무료로 GPU 연산을 수행할 수 있습니다.

Google Colab에서 열기

RDKit Curation이란?

RDKit Curation은 라이브러리를 가상탐색에 적합하게 정제하는 필수 전처리 과정입니다. 잘못된 분자 구조를 고치고, Lipinski 규칙이나 PAINS(False Positive) 필터를 적용해 의미 있는 유효 물질만 선별합니다.

Lipinski Rule
경구용 신약 후보물질의 기본 4가지 규칙. (MW < 500, LogP < 5 등)
PAINS Filter
구조적으로 문제를 일으키는 가짜 활성 물질(거짓 양성)을 제거합니다.
Standardization
전하를 중화하고 3D 구조 생성 전 혼란을 줄 수 있는 이온 상태를 정리합니다.