Run on Google Colab
분자 동질학 시뮬레이션 결과(DCD, PRMTOP)로부터 결합 자유 에너지를 정밀 계산하기 위한 원클릭 코랩 엔진. AMBER 및 MM-GBSA.py가 완벽하게 구성되어 있습니다.
Launch Colab EngineMM-GBSAFree EnergyPK/PD Profile
Requires Trajectory & Topology Files
Advanced Energy Decomposition
Binding Energy Guide
MM-GBSA
Molecular Mechanics-Generalized Born Surface Area 방식을 통해 친화도를 계산합니다.
Free Energy
결합 전후의 자유 에너지 차이를 분석하여 바인딩 강도를 정량화합니다.
Traj Processing
MD 시뮬레이션에서 생성된 스냅샷들을 기반으로 앙상블 평균을 산출합니다.
Residue Dec.
각 잔기별 에너지 기여도를 분석하여 주요 상호작용 지점을 식별합니다.