Binding Energy Calculator
MM-GBSA Free Energy Evaluation
Google Colab WorkerT4 GPU 무료
버튼을 클릭하면 Binding Energy 노트북이 브라우저에 열립니다.
데이터를 업로드하고 셀을 순서대로 실행하면 무료로 GPU 연산을 수행할 수 있습니다.
①런타임 → GPU(T4)/CPU
②입력 데이터 업로드
③모두 실행 → 결과 확인
MM-GBSA Binding Energy란?
MM-GBSA 기법을 활용하여 단백질과 리간드 간 복합체의 정확한 절대 결합 자유 에너지(Binding Free Energy)를 계산합니다. 일반 도킹 소프트웨어가 제공하는 점수보다 훨씬 더 실험값(IC50, Kd)에 근접한 값을 예측할 수 있습니다.
ΔG Score
음수 값이 클수록 강한 결합을 의미하며(-40 kcal/mol 보통 기준).
Solvation Energy
수용액 환경에 화합물이 녹아들어 결합할 때의 용매화 효과를 고려합니다.
Entropy
결합 시 발생하는 엔트로피 변화를 근사하여 실제 에너지 손실을 반영합니다.