Protein Prep

PDB Cleaning & Chain Extraction

수천 개의 PDB 파일을 동시에 처리하기 위한 원클릭 코랩 파이프라인. Biopython과 OpenBabel이 사전 구성된 환경에서 즉시 실행하세요.

PDB ParserProtonationChain Sort

'File' → 'Save a copy in Drive'
Parallel Processing Supported

Chain Selection

특정 체인만 분리하여 도킹 대상을 명확히 합니다.

Heteroatoms

불필요한 Hetatm을 제거하고 결합에 필수적인 금속 이온만 남깁니다.

Protonation

생체 내 환경(pH 7.4)에 맞게 수소 원자를 자동으로 추가합니다.

Target Coords

추출된 리간드 또는 특정 잔기의 중심 좌표를 자동 계산합니다.