Ligand Preparation

3D Conformer Generator & Optimization

버튼을 클릭하면 Ligand Preparation 노트북이 브라우저에 열립니다.
데이터를 업로드하고 셀을 순서대로 실행하면 무료로 GPU 연산을 수행할 수 있습니다.

①런타임 → GPU(T4)/CPU

②입력 데이터 업로드

③모두 실행 → 결과 확인

Ligand Preparation이란?

리간드 준비(Ligand Prep)는 2D 화합물(SMILES, SDF)을 도킹을 위한 3D 구조로 변환합니다. MMFF94와 같은 역장(Force Field)을 사용하여 에너지가 가장 안정한 3D 포즈(Conformer)를 찾아 도킹 성공률을 극대화합니다.

3D Conversion

단순한 2D 화학 구조식을 입체적인 3D 구조로 변환합니다.

MMFF94

역장을 기반으로 내부 결합 각도와 비틀림 에너지를 최적화합니다.

Tautomers

화합물이 가질 수 있는 여러 호변이성질체(Tautomer)를 생성합니다.